DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Pyrococcus abyssi'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3MB5_A_SAMA301 3mb5 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine)
Pyrococcus abyssi SAM-DEPENDENT
METHYLTRANSFERASE
PF08704
(GCD14)
PF14801
(GCD14_N)
16 ILE A  76
VAL A  77
GLY A 101
GLY A 103
SER A 104
ALA A 106
LEU A 107
GLU A 125
ILE A 126
ARG A 127
ASP A 153
ILE A 154
TYR A 155
ASP A 169
LEU A 170
PRO A 171
SAM A 301
4S0V_A_SUVA2001 4s0v SUV

DB09034
(Suvorexant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
HUMAN OREXIN
RECEPTOR TYPE 2
FUSION PROTEIN TO P.
ABYSII GLYCOGEN
SYNTHASE
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
17 THR A 111
VAL A 114
TRP A 120
ILE A 130
PRO A 131
GLN A 134
THR A 135
VAL A 138
GLN A 187
GLU A 212
HIS A 224
TYR A 317
ILE A 320
ASN A 324
HIS A 350
VAL A 353
TYR A 354
SUV A2001
4ZJ8_A_SUVA2001 4zj8 SUV

DB09034
(Suvorexant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
HUMAN OX1R FUSION
PROTEIN TO P.ABYSII
GLYCOGEN SYNTHASE
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
18 ALA A 102
SER A 103
VAL A 106
TRP A 112
ILE A 122
PRO A 123
GLN A 126
VAL A 130
GLN A 179
MET A 183
GLU A 204
HIS A 216
PHE A 219
ILE A 314
ASN A 318
HIS A 344
VAL A 347
TYR A 348
SUV A2001
5HJI_A_ADNA401 5hji ADN

DB00640
(Adenosine)
Pyrococcus abyssi TRNA
(GUANINE(37)-N1)-MET
HYLTRANSFERASE TRM5A
PF02475
(Met_10)
11 LEU A 131
TYR A 132
ARG A 133
PHE A 191
GLY A 193
GLU A 213
ILE A 214
ASN A 215
ASP A 243
VAL A 244
PRO A 262
ADN A 401
6HLO_A_GBQA1501 6hlo GBQ

DB00673
(Aprepitant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
SUBSTANCE-P
RECEPTOR,GLGA
GLYCOGEN
SYNTHASE,SUBSTANCE-P
RECEPTOR
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
21 MET A  81
ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
ILE A 116
GLN A 165
ILE A 182
TRP A 184
GLU A 193
TYR A 196
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
ILE A 204
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
MET A 291
MET A 295
GBQ A1501
6HLP_A_GAWA1501 6hlp GAW

DB09048
(Netupitant)
Homo sapiens;
Pyrococcus abyssi
SUBSTANCE-P
RECEPTOR,SUBSTANCE-P
RECEPTOR
PF00001
(7tm_1)
PF00534
(Glycos_transf_1)
17 ASN A  89
ASN A 109
PRO A 112
ILE A 113
ILE A 116
GLN A 165
HIS A 197
VAL A 200
THR A 201
ILE A 204
TRP A 261
PHE A 264
HIS A 265
PHE A 268
PRO A 271
TYR A 272
MET A 295
GAW A1501